台湾大学设有14个学院，重要学科领域包括：医学（磁共振成像）；历史（东亚儒学思想史）；政治学（东亚民主化）；心理学（华人本土心理学）；物理学（粒子物理学、天文物理学、宇宙学）；材料学（奈米材料、有机光电材料）；电信科技；生物科技；教育（基础科学教育）；法学；管理学（会计）；管理学（金融）。

文学院

中国文学系暨研究所；历史学系暨研究所；哲学系暨研究所；外国语文学系暨研究所；人类学系暨研究所；图书资讯学系暨研究所；日本语文学系暨研究所；戏剧学系暨研究所；艺术史研究所；语言学研究所；音乐学研究所。

理学院

数学系暨研究所；物理学系暨研究所；化学系暨研究所；地质学系暨研究所；动物学系暨研究所；植物学系暨研究所；心理学系暨研究所；地理环境资源学系暨研究所；大气科学系暨研究所；海洋研究所；生化研究所；渔业科学研究所。

医学院

医学系；牙医学系暨研究所；药学系暨研究所；医事技术学系

暨研究所；护理学系暨研究所；物理治疗学系暨研究所；职能治疗学系；临床医学研究所；临床牙医学系研究所；生理学研究所；生物化学暨分子生物学研究所；药理学研究所研究所；病理学研究所；微生物学研究所；解剖学研究所；毒理学研究所；分子医学研究所；免疫学研究所；口腔生物科学研究所；医学工程学研究所。

工学院

土木工程学系暨研究所；机械工程学系暨研究所；化学工程学系暨研究所；工程科学及海洋工程学系暨研究所；材料科学与工程学系暨研究所；环境工程学研究所；应用力学研究所；建筑与城乡研究所；工业工程学研究所；医学工程学研究所；高分子科学与工程学研究所。

社会科学院

政治学系暨研究所；经济学系暨研究所；社会学系暨研究所；社会工作学系暨研究所；国家发展研究所；新闻研究所；生物资源暨农学院；农艺学系暨研究所；生物环境系统工程学系暨研究所；农业化学系暨研究所；植物病理与微生物学系暨研究所；森林学系暨研究所；畜产学系暨研究所；农业经济学系暨研究所；园艺学系暨研究所；兽医学系暨研究所；农业推广学系暨研究所；生物产业机电工程学系暨研究所；昆虫学系暨研究所；食品科技研究所。

管理学院

工商管理学系；会计学系暨研究所；财务金融学系暨研究所；国际企业学系暨研究所；资讯管理学系暨研究所；商学研究所；公共卫生学院；公共卫生学系；职业医学与公共卫生研究所；流行病学研究所；医疗机构管理研究所；环境卫生研究所；卫生政策与管理研究所；预防医学研究所。

电机资讯学院

电机工程学系暨研究所；资讯工程学系暨研究所；资讯网路与多媒体研究所；光电工程学研究所；电信工程学研究所；电子工程学研究所。

法律学院

法律学系；科际整合法律学研究所；其他附设单位及研究中心。

公卫学院

职业医学与工业卫生研究所；环境卫生研究所；公共卫生学系；公共卫生硕士学位学程；流行病学与预防医学研究所；健康政策与管理研究所；其他附设单位及研究中心。

生命科学院

生命科学系；生化科技学系；植物科学研究所；分子与细胞生物学研究所；生态学与演化生物学研究所；渔业科学研究所；生化科学研究所；基因体与系统生物学学位学程；其他附设单位及研究中心。

生物资源暨农学院

农艺学系；生物环境系统工程学系；农业化学系；森林环境暨资源学系；动物科学技术学系；农业经济学系；园艺暨景观学系；生物产业传播暨发展学系；生物产业机电工程学系；昆虫学系；植物病理与微生物学系；食品科技研究所；生物科技研究所；植物医学硕士学位学程；其他附设单位及研究中心。

兽医专业学院

兽医学系；临床动物医学研究所；分子暨比较病理生物学研究所；其他附设单位及研究中心。

牙医专业学院

牙医学系；临床牙医学研究所；口腔生物科学研究所。

药学专业学院

药学系；临床药学研究所；其他附设单位及研究中心

台湾大学校门校总区 - 台北市大安区 108.62 公顷；法学院、社会科学院、公共卫生学院 - 台北市中正区4.75 公顷；

医学院- 台北市中正区 9.81 公顷；

台大医院 - 台北市中正区 7.79 公顷；

农业试验场 -新北市新店区 19.5 公顷；

文山植物园试验地 - 新北市石碇区 5.03 公顷；

实验林场- 南投县信义乡、水里乡及鹿谷乡 33310.29 公顷；

实验林管理处 - 南投县竹山镇 25.87 公顷；

雾社山地农场 - 南投县仁爱乡 1019.08 公顷；

竹北校区 - 新竹县竹北市 44 公顷（计划） ；

云林校区 - 云林县虎尾镇 60.38 公顷（计划）。